本发明公开了一种考虑电池自消耗的储能优化配置方法，属于发电、变电或配电的技术领域。该方法：以配置储能后微网运行的年收益为上层目标函数、以系统的污染物排放量为下层目标函数，建立储能配置的双层优化模型；上层优化模型中考虑储能电池的自身电能消耗，并将电池的循环次数和储能的容量、功率配置共同作为决策变量；对上层目标函数进行优化得到功率分配方案及储能配置方案，将上层配置方案传递给下层优化模型以优化系统购电功率，将系统购电功率返回上层模型计算系统的年收益进行迭代优化直至输出储能的最优配置结果。本发明通过考虑了电池自身电能消耗和循环使用次数约束的双层优化模型得到更加符合实际运行特征的储能容量配置方案。