本发明是一种基于多源异构数据融合的自动报表系统，其特点是：它包括全局设置及控制模块、形成数据源的自定义表、数据抓取模块、数据融合模块和自动报表模块。所述全局设置及控制模块是提供设置、控制所述自动报表系统运行及操作界面的程序；所述数据抓取模块由N个数据抓取子程序构成，用于抓取N个数据源系统的统一XML格式的数据；所述数据融合模块由一个接口文件和N个中间数据文件构成，能够实现多源异构数据的自动融合；所述自动报表模块是独立流程自动化子程序，能够将欲录入上报网页的数据从融合后的接口文件读入数组后再写入网页对应文本框，以实现从两个及以上独立专业系统获取数据并融合后自动填入另一个网页上报系统中。