本发明提供了一种多层级分布式国民体质监测系统及其搭建方法，包括体质数据测试单元、体质数据上报单元、体质数据融合单元、体质数据审计单元、体质数据统计分析单元、健康知识库单元、健康报告生成单元、健康指导建议生成单元、监测人群管理单元、监测站点管理单元；本发明能够满足三级或更多级别结构的国民体质监测机构的管理要求，具有很高的可配置性和实用性。各节点能够独立运行和提供服务，同时通过数据同步技术，共同为跨节点的测试者提供统一的、无差异的国民体质监测服务。将单纯的国民体质监测系统和健康促进系统做了整体融合，形成国民体质监测和国民体质改善服务闭环，更有效推进国民体质监测工作。