本发明提供一种用于车辆的混合动力控制系统和方法，涉及车辆发动机领域。混合动力控制系统包括整车控制器、动力分配系统、动力电池和发动机。发动机包括多个线圈组和多个磁性活塞。每一个线圈组均与动力电池连接，用于接收动力分配系统的调节为动力电池充电。多个磁性活塞一一对应设置于每个线圈组内，通过闭合线圈组切割磁性活塞形成的运动磁场发电，以为动力电池充电。整车控制器配置成根据车辆的行驶速度和动力电池的电量控制动力电池和/或发动机驱动车辆，以及根据动力电池的电量选择性地控制动力分配系统分配发动机驱动车辆和动力电池充电的动力。本发明的方案能够有效避免能量转换造成的能量损失。