本发明公开了一种可降解农药残留、降低重金属含量的生物刺激素制备方法，涉及生物刺激素。本发明采用含硒种子培养基培养盐沼鳞质霉菌，然后取盐沼鳞质霉菌菌丝进行发酵，在适当时机接入壳聚糖和皂荚壳分别发酵得到发酵液A、B，将50‑65%发酵液A和35‑50%发酵液B混合均匀，调节混合液pH至6.5‑7.0，即得该生物刺激素。采用该方法制取的生物刺激素经叶面喷施后可以有效促进植物生长，降解农作物体内农药残留85%以上，降低重金属含量80%以上。