本发明公开了一种高比例可控源荷接入的花瓣式配电网故障自愈方法及系统，所述方法包括：实时采集花瓣式配电网的运行参数以及开关状态组合；当所述花瓣式配电网识别到故障时，断开故障所在区段相邻开关，并记录故障时的运行参数以及开关状态组合；将故障时运行参数以及开关状态组合输入预设的自愈优化模型中，计算获得故障自愈后最优的开关状态组合以及各可控源荷的最优有功出力和无功出力；根据所述最优的开关状态组合以及各可控源荷的最优有功出力和无功出力生成对应花瓣式配电网内各终端设备的控制指令，并向对应的终端设备下发控制指令；所述方法及系统可有效减低二次故障风险，进一步提高配电网的安全性和可靠性。