本发明属于岩土工程领域，具体涉及适用于夹薄持力层的深厚软基地基处理结构及施工方法，其中，所述地基处理结构包括：筏板；褥垫层，设置于所述筏板底部，所述褥垫层位于上部软土地基层顶部；管桩，间隔设置，所述管桩设置于所述褥垫层底部，所述管桩下端位于中部持力层中；搅拌桩，间隔设置，所述搅拌桩，设置于所述褥垫层底部，所述搅拌桩位于上部软土地基层中。本发明所述的一种适用于夹薄持力层的深厚软基地基处理结构，节约了工程投资；减小了复合地基的沉降并提高了复合地基的承载力，解决了管桩位于中部持力层地基沉降大、地基承载力低和管桩易刺穿中部持力层的问题。