本发明公开了一种用于对分布式仿真系统进行协同运算的方法及系统，其中方法包括：分布式仿真系统中包括时间同步管理器，通过所述时间同步管理器采用标量逻辑时间统一所述分布式仿真系统中各子系统的时钟周期；基于所述分布式仿真系统中事件频率期望调整所述时间同步管理器的同步时钟频率；对所述分布式仿真系统中仿真事件传输的时延进行计算，获取时延计算结果；根据所述时延计算结果控制所述仿真事件的到达时序，以进行所述分布式仿真系统中各子系统的协同运算。