本发明公开了一种含莫西菌素注射用缓释凝胶制剂及其制备方法，将莫西菌素、缓释剂、保湿剂、防腐剂及凝胶基质按照一定的比例，按照一定的方法制成含莫西菌素注射用缓释凝胶制剂。该制剂对家畜及犬猫等宠物体内的消化道线虫及体表的寄生虫具有高效杀灭作用，特别是对绵羊产生伊维菌素耐药的线虫，能有效的防治家畜及犬猫体内外寄生虫病。本发明的凝胶制剂具有制备方法简单，生物相容性好、缓释、高效等特点，可用于皮下及肌肉局部注射，防治家畜及犬猫等宠物的寄生虫病。