本发明公开了一种热泵热水器及其控制方法。热泵热水器，包括冷媒流路，所述冷媒流路包括连接在一起的压缩机、冷凝器、节流装置和蒸发器，还包括相互独立设置的第一水箱和第二水箱，所述第一水箱配置有第一进水管和第一出水管，所述第二水箱配置有第二进水管和第二出水管，所述第二水箱中还设置有用于吸收并储存热量的相变储能部件；所述冷凝器包括用于对所述第一水箱进行加热的第一冷凝部，所述冷凝器还包括用于对所述第二水箱进行加热的第二冷凝部。实现提高热泵热水器的热水输出率，并提高户体验性。