本发明公开了一种基于能量守恒原理的输水明渠三断面测流方法，S1，构建渠道三断面测流环境；S2，流量监测控制器发出控制指令，控制水位监测仪在设定的监测时段Δt内按照设定的采集频率，同步采集上游侧监测断面Ls的水位数据和下游侧监测断面Lx的水位数据；S3，被监测断面Le的过流量计算：根据三断面能量守恒原理，上游侧监测断面Ls瞬时平均总能量ELS减去下游侧监测断面Lx瞬时平均总能量ELx等于被监测断面Le的平均动量变化ΔELx,同时根据渠道水流连续方程Qs=Qx=Qe，从而得到被监测断面Le在Δt时段的平均流量。本发明突破了传统的测流方法，消除了传统测流方式换能装置能量转换所带来的误差，不需要参数率定，具有测量精度高，安装、测流简便的优点。