本发明公开了适用于柔性直流电网的交流耗能电阻优化配置方法及系统，包括：根据新能源经柔性直流输电送出系统拓扑及运行参数，判断导致网内盈余功率最多的故障类型；根据给定的耗能电阻投入时间，得到配置耗能电阻后直流电压上升时间与故障导致的盈余功率的关系；在故障导致的网内盈余功率最多的情况下，依据新能源发电功率控制响应时间与直流电压上升时间尺度匹配原则，计算出系统所需配置的最优交流耗能电阻容量。本发明在保证新能源经柔性直流输电送出系统安全输送功率的前提下，优化交流耗能电阻的配置，使得造成系统中盈余功率最多的故障发生后，直流电压上升至过压保护动作限值前，新能源机组的发电功率得到控制。