本发明公开了一种处理有机废气的低温等离子体-生物集成反应系统的使用方法，包括以下步骤：将低温等离子体反应装置的石英管打开，向其中装填催化剂，装填完毕后将石英管置于绝缘层中，并在低温等离子体反应装置的气体出气口管壁内涂布Mn-Al2O3催化剂涂层；集气体流量精确控制、低温等离子体高效预处理、气-液-固三相高效反应于一体，具有控制二次污染、控制精度高、安全性能优良、自动化程度高等明显优势。本发明反应系统利用PLC根据实时数据反馈动态调整自动精确调节放电电压和液气比等参数，可有效提高污染物处理精度和效率，解决二次污染影响，降低运行成本和系统能耗，实现了系统的自动化，废气和污染物处理能力明显提升。