本发明公开了一种滤清器集中控制系统，包括过滤器控制器，过滤器控制器连接有空滤压力传感器、空滤进口PM传感器、空滤出口PM传感器、空滤RFID标签、空滤天线、燃滤进口PM传感器、燃滤出口PM传感器、燃滤RFID标签、燃滤天线、机滤进口PM传感器、机滤出口PM传感器、机滤RFID标签和机滤天线；本发明还公开了滤清器集中控制方法以及机动车滤清器滤芯旁通的检测方法；本发明能够对机动车用三种滤清器集中控制的方法，使用一个控制器监控三种滤清器，能够监控用户使用假滤芯的情况，在滤芯报废前提醒用户及时更换滤芯，在高温时保护机滤RFID标签，防止用户将新滤芯误认为旧滤芯，能够预测滤芯剩余寿命，方便用户在寿命到期前及时更换滤芯。