本发明提供了一种小分子化合物ML‑SA1在制备抗病毒药物中的应用。该发明通过在A549细胞和huh7细胞两种细胞系内，小分子化合物ML‑SA1均以浓度依赖的方式抑制细胞内病毒RNA转录水平和E蛋白的表达水平，表明小分子ML‑SA1在一定浓度梯度范围内对ZIKV和DENV‑2的抑制效应不具有细胞特异性，而且小分子ML‑SA1通过作用早期进入阶段发挥抗病毒效应，其抗ZIKV效应不依赖于病毒的滴度且不影响TRPML2蛋白的转录水平；另外，通过CCK‑8法检测表明小分子化合物ML‑SA1在抗病毒活性浓度梯度内无细胞毒性。