本发明公开了一种适用于生物反应器的硫自养反硝化填料及其制备方法和用途，所述的硫自养反硝化填料以磷石膏还原得到的含硫物、乙基纤维素、司盘80、碳酸氢钠混合均匀之后，加入乙醇溶解并搅拌制得糊状物，之后将糊状物倒入模具并干燥成型后即可制得。利用制得的硫自养反硝化填料，在缺氧条件、合适的水力停留时间下可将低碳源含氮污染废水中的硝酸盐氮还原为氮气，出水中硫酸盐浓度及反硝化中间产物亚硝酸盐氮的浓度均较低，不会产生二次污染。本发明制备的新型高效填料制备过程简单，实现了废物资源化利用，为低碳源含氮废水提供高效的脱氮方法。