本发明涉及一种深空撞击器智能自主温度控制结构及温度控制方法，该结构包括：产能单元外罩、第一产能单元组份、第二产能单元组份、相变储能材料以及导热带；相变储能材料位于产能单元外罩和导热带之间，三者平行紧贴串联安装，相变储能材料和深空撞击器的控制模块之间通过导热带紧密贴合；两种组份设置在产能单元外罩内部。深空撞击器撞击前，产能单元壳体内的两种组份处于分离状态；撞击时产生过载加速度，两种组份融合产生热能，存储在相变储能材料中，撞击后相变储能材料逐步释放能量，为深空撞击器的控制模块保温，支撑深空撞击器生存。