- 专利标题： 一种高重复原鮡属鱼类的染色体级别组装的方法
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申请号： CN202010398939.3申请日： 2020-05-12
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公开(公告)号： CN111564182B公开(公告)日： 2024-02-09
- 发明人: 刘海平 , 牟振波 , 肖世俊
- 申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
- 申请人地址： 西藏自治区拉萨市城关区金珠西路130号
- 专利权人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
- 当前专利权人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
- 当前专利权人地址： 西藏自治区拉萨市城关区金珠西路130号
- 代理机构： 武汉天领众智专利代理事务所
- 代理商 杨建军
- 主分类号： G16B30/20
- IPC分类号： G16B30/20 ; G16B30/10 ; G16B50/00
摘要：
发明涉及一种高重复原鮡属鱼类的染色体级别组装的方法，其步骤为：1)基于短片段的序列进行基因组调查；2)大于200kb的高质量DNA提取；3)DNA测序文库构建及其纳米孔测序；4)对于测序结果进行组装获得染色体级别组装结果。本发明相对于以往方法测序深度只有五分之一，可以组装到染色体完成图，组装结果提高10倍以上。本发明在开发原鮡属鱼类的基因组上具有重要意义，进一步对于降低高原原鮡属的成本、获得高质量遗传资源、研究高原鱼类的适应性进而(56)对比文件ChaoweiZhou 等.Comprehensivetranscriptome data for endemicSchizothoracinae fish in the TibetanPlateau《.scientific data》.2020,1-8.Xuefen Yang 等.Chromosome-levelgenome assembly of Triplophysa tibetana,a fish adapted to the harsh high-altitudeenvironment of the Tibetan Plateau.《Molecular Ecology Resources》.2019,第19卷(第4期),1027-1036.
公开/授权文献
- CN111564182A 一种高重复原鮡属鱼类的染色体级别组装的方法 公开/授权日：2020-08-21
