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公开(公告)号：CN117830823B
公开(公告)日：2024-07-02
申请号：CN202311522632.X
申请日：2023-11-15
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
IPC分类号： G06V20/10 , G06V10/44 , G06V10/26 , G06V10/764 , G06Q50/26
摘要： 本发明涉及水面率计算领域，尤其涉及一种城市水生态保护的水面率值域测算方法。该方法包括以下步骤：利用卫星遥感技术获取目标区域图像；对目标区域图像进行多光谱分析，以生成水陆光谱数据；基于水陆光谱数据对目标区域图像进行水陆轮廓识别，以标记水陆轮廓；根据水陆轮廓对目标区域图像进行水域边缘划分，以构建水域图像；基于水域图像对目标检测水域进行水体生物采集，以得到水体生物样本；对水体生物样本进行微流控芯片阵列注入处理，并将水体生物样本放回目标检测水域，以获取水体生物特征数据；对水体生物特征数据进行水生物空间分布分析，以生成水生物空间分布数据。本发明实现了准确的水面率值域计算。
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公开(公告)号：CN111564182B
公开(公告)日：2024-02-09
申请号：CN202010398939.3
申请日：2020-05-12
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
摘要： 发明涉及一种高重复原鮡属鱼类的染色体级别组装的方法，其步骤为：1)基于短片段的序列进行基因组调查；2)大于200kb的高质量DNA提取；3)DNA测序文库构建及其纳米孔测序；4)对于测序结果进行组装获得染色体级别组装结果。本发明相对于以往方法测序深度只有五分之一，可以组装到染色体完成图，组装结果提高10倍以上。本发明在开发原鮡属鱼类的基因组上具有重要意义，进一步对于降低高原原鮡属的成本、获得高质量遗传资源、研究高原鱼类的适应性进而(56)对比文件ChaoweiZhou 等.Comprehensivetranscriptome data for endemicSchizothoracinae fish in the TibetanPlateau《.scientific data》.2020,1-8.Xuefen Yang 等.Chromosome-levelgenome assembly of Triplophysa tibetana,a fish adapted to the harsh high-altitudeenvironment of the Tibetan Plateau.《Molecular Ecology Resources》.2019,第19卷(第4期),1027-1036.
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公开(公告)号：CN111584004B
公开(公告)日：2023-06-27
申请号：CN202010399433.4
申请日：2020-05-12
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
摘要： 本发明涉及一种基于三维组学数据的西藏特色鱼类基因组组装方法，该方法将西藏特色鱼类待测样本的Hi‑C测序数据比对到该待测样本初步基因组contig序列中获得contig序列之间的位置关系，然后填补contig序列之间的空缺获得高质量的西藏特色鱼类基因组编码信息。因此，本发明的方法显著提高了组装结果中contig水平的连续性，从而提升特色西藏鱼类复杂基因组组装的质量。同时，本发明的组装方法获得连续性更好的参考基因组，为后续进行大规模基因组上的基因进化和功能研究提供保障，也更有利于西藏和其他地区鱼类的相关功能基因的QTL定位和GWAS研究，以及相关的群体遗传多样性和群体结构研究。
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公开(公告)号：CN111583995B
公开(公告)日：2023-06-16
申请号：CN202010398936.X
申请日：2020-05-12
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
摘要： 发明涉及一种多倍体生物基因组二倍化程度量化评估的方法，包括以下步骤：1)根据基因组的Kmer分析结果，评估基因组的杂合度；2)根据基因组的杂合度特征，构建多倍体基因组特征模型；3)在该多倍体基因组特征模型基础上，模拟不同二倍化程度的多倍体基因组；4)评估多倍体二倍化率估计的准确性，并计算获得该多倍体基因组的二倍化程度。本方法首次利用重测序数据进行多倍体基因组二倍化分析，成本低，适用于动植物的多倍体基因组研究。
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公开(公告)号：CN111738279B
公开(公告)日：2022-01-04
申请号：CN202010585968.0
申请日：2020-06-24
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所 , 武汉理工大学
IPC分类号： G06V20/05 , G06V10/764 , G06V10/50 , G06V10/774 , G06V10/26 , G06V10/22 , G06V10/147 , G06T7/90 , G06T7/13 , G06T7/10 , G06T7/62
摘要： 本发明涉及鱼类表型提取技术领域，提供一种无接触式鱼类形态表型自动获取装置及方法。该装置包括CCD传感器组件、拍摄支架、图像处理装置。该方法包括：步骤1：工作准备；步骤2：使用CCD传感器组件获取三视图；利用图像处理装置执行步骤3至9：步骤3：判断三视图是否符合表型提取要求；步骤4：根据俯视图获取鱼的方位参数与宽度参数；步骤5：从主视图与左视图中选取用于表型提取的主图；步骤6：获取主图的主要颜色区间；步骤7：提取鱼类各个部位的boundingbox；步骤8：提取各个部位的特征点；步骤9：根据特征点计算全局表型参数。本发明能够无接触地自动、快速且精确获取鱼类的全局形态表型参数，不会对鱼类造成伤害。
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公开(公告)号：CN113269078A
公开(公告)日：2021-08-17
申请号：CN202110551735.3
申请日：2021-05-20
申请人： 中国水利水电科学研究院 , 华电西藏能源有限公司 , 西南大学 , 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
摘要： 本发明涉及一种基于无人机的江河鱼类资源量统计方法及系统，包括：利用无人机和无人船获得待统计河流的水深数据；根据待统计河流的宽度数据、长度数据和水深数据获得待统计河流上游断面和下游断面之间的水体体量；从待统计河流的上游断面和下游断面之间选择N个断面；获得各断面两侧设定范围内水下图像数据；根据各断面两侧设定范围内水下图像数据，采用图像识别算法统计各断面两侧设定范围的鱼的种类和数量；根据各断面两侧设定范围的鱼的种类和数量，获得设定范围内鱼的种类的平均值和数量的平均值；根据水体体量与设定范围内鱼的种类的平均值和数量的平均值，获得待统计河流中鱼的种类和数量。本发明提高了统计效率和精度。
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公开(公告)号：CN111754527A
公开(公告)日：2020-10-09
申请号：CN202010585973.1
申请日：2020-06-24
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所 , 武汉理工大学
摘要： 一种基于三维扫描模型的鱼类表型自动提取方法，所属生物信息领域，提取方法包括搭建鱼类三维扫描平台；鱼麻醉；扫描三维模型；三维模型的预处理；目标模型分割并定义；选取关键点；计算鱼类表型性状。本发明能够在不杀害鱼的前提下获得鱼的三维模型数据，并且能快速、精确、全面地提取出鱼类表型数据，能够计算表面积、体积、关键点之间的曲线距离等难以测量的表型数据，本发明方法操作快捷简单，节省人力，具有良好的可实现性。
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公开(公告)号：CN111728634A
公开(公告)日：2020-10-02
申请号：CN202010586997.9
申请日：2020-06-24
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所 , 武汉理工大学
摘要： 一种软体动物CT扫描装置及其使用方法，所属计算机断层扫描装备技术领域，装置包括可升降载物台、固定低密度材料的可伸缩样本夹具和玻璃容器；装置使用时，将软体动物处理后通过夹具固定，连接可升降载物台后一并放置到玻璃容器中，进行CT扫描时借助升降载物台和夹具轨道，能够根据动物体态准确有效的进行固定并位移，以获得多段的软体动物CT图像。本发明装置简单，使用操作便捷，CT扫描图像质量高，并且制造成本较低，具有良好的实用性。
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公开(公告)号：CN111564180A
公开(公告)日：2020-08-21
申请号：CN202010397964.X
申请日：2020-05-12
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
摘要： 发明涉及一种鮡科鱼类古染色体进化比较分析的方法，使用比较基因组技术对鮡科鱼的古染色体进行分析，对其染色体的进化研究有利于摸清其基因组的进化规律，为鮡科鱼的进化研究和资源保护提供基本的数据。本发明提出的方法包括黑斑原鮡染色体序列构建、系统发育分析、近缘物种染色体比较和古染色体构建等步骤，适用于西藏鮡科鱼类，可广泛应用于青藏高原鮡科鱼的资源调查和保护研究。
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公开(公告)号：CN111564180B
公开(公告)日：2024-08-06
申请号：CN202010397964.X
申请日：2020-05-12
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
摘要： 发明涉及一种鮡科鱼类古染色体进化比较分析的方法，使用比较基因组技术对鮡科鱼的古染色体进行分析，对其染色体的进化研究有利于摸清其基因组的进化规律，为鮡科鱼的进化研究和资源保护提供基本的数据。本发明提出的方法包括黑斑原鮡染色体序列构建、系统发育分析、近缘物种染色体比较和古染色体构建等步骤，适用于西藏鮡科鱼类，可广泛应用于青藏高原鮡科鱼的资源调查和保护研究。
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