本发明提供的一种无人机的航空施药航线生成方法及系统，包括：采集待施药区域的现场害虫监测及气象数据，遥感采集待施药区域的地面点云和高光谱数据；基于支持向量机融合作物数据、现场害虫监测数据、气象数据、地面点云以及高光谱数据，计算待施药区域中的各子区域内的病虫害类型和病虫害危害等级；根据各子区域内的病虫害类型确定防治方案；根据各子区域内的病虫害危害等级生成施药处方图；结合无人机喷洒系统类型，生成作业航线图。本发明实施例通过获取现场监测数据、点云数据和高光谱数据，利用气象数据和生物量数据，建立多重分类器校正害虫诱捕数据和高光谱数据提升了病虫害识别精度，同时生成无人机实时处方图，实现了航空精准施药。