本发明公开了一种混合储能系统的能量管理和容量配置的优化系统及方法。该优化系统包括信号采集系统，混合储能能量管理系统，负荷缺电率监测系统，优化配置系统。该优化方法通过对微电网中光伏单元输出功率和负载单元需求功率的采集，配合混合储能系统的能量管理策略，搭建混合储能容量配置优化的模型，以负荷缺电率为评价指标，以混合储能系统全寿命周期内的净现值费用为优化目标，利用增强型烟花算法对模型进行求解，获取最佳混合储能容量配置方案。本发明不仅可以增加光伏输出功率的利用率，还可以有效降低微电网的成本，易于实现和推广。