本发明公开了一种用于活塞冷却喷嘴的主动保护方法和系统，属于发动机技术领域。所述主动保护方法包括以下步骤：获取当前发动机活塞冷却喷嘴的开启状态，若所述活塞冷却喷嘴开启，且连续开启时长大于第一设定值，则进行下一步骤；强制关闭所述活塞冷却喷嘴，关闭时长由发动机MAP图获取，所述发动机MAP图为预先制定的根据发动机的转速信息和近5个发动机工作循环内汽缸内平均有效压力值确定活塞冷却喷嘴关闭时长的图表。本发明通过对活塞冷却喷嘴采用间歇工作的方式，实现对活塞冷却喷嘴的主动保护，提高活塞冷却喷嘴的使用寿命。