本发明涉及健康风险评估领域，公开了一种健康风险评估系统。包括：一处理单元，用于根据复数个不同的病症的患者信息构建所有病症的病症特征字典；一接收单元，与处理单元连接，用于根据病症特征字典接收并处理待测用户的用户信息；一检测单元，与接收单元、处理单元连接，用于根据用户信息和病症特征字典获取用户信息对应的稀疏向量和残差向量，并根据稀疏向量和残差向量得到用户对应于每个病症的重构残差，将所有重构残差作为风险评估结果输出。本发明的技术方案有益效果在于：提供一种健康风险评估系统，不仅能够得到准确的风险评估结果，还能缩短风险评估结果的处理时间。