本发明公开了一种纺锤形鱼类注射用的自动夹持装置，包括外壳、执行部件、调节部件和控制模块。外壳上开有供注射用的狭缝和供鱼进入的开口；执行部件中的气缸直线运动带动上、下夹板相对转动，实现上、下夹板对鱼苗的夹持及放行；控制模块用于控制气缸从而控制上、下夹板的相对转动；工作前通过调节部件保证执行部件中的鱼苗对准侧挡板的狭缝。本发明可以实现在鱼类疫苗注射系统中对不同大小、不同类型的纺锤形鱼苗进行自动夹持与放行，具有自动化程度高、可靠性强等优点，配合注射装置使用时注射成功率高，能有效提高鱼苗自动化接种效率。