本发明提供了一种含巯基氟硅树脂、UV光固化超疏水防护涂料及制备方法，采用纳米无机材料、巯基硅烷和含氟硅烷，利用原位水解-缩聚法制备了含巯基氟硅树脂中间体，采用硅氮烷消除含巯基氟硅树脂中间体内的硅羟基，制备得到含巯基氟硅树脂；采用含巯基氟硅树脂、以丙烯酰氧基POSS作为交联剂，并添加光引发剂和溶剂，制备了UV光固化涂料。本发明中涂料采用UV光照下巯-烯点击化学反应替代丙烯酸酯固化体系，具有更高的双键转化率；含氟链段的引入使得涂层具有更低的介电常数；氟硅树脂中残留硅羟基的消除，提高了涂层的疏水性；含POSS的氟硅树脂与纳米无机材料共同构筑的微纳结合结构使涂层表面具有超疏水性，在电子防护领域具有较好的应用前景。