本发明涉及一种基于云计算的多区块链的链上数据存储系统及方法，本发明的技术方案设置一个或多个云存储，通过所述云存储对多个区块链的链上数据进行存储；对区块链的原始区块数据及原始数字证书进行封装并存储；通过所述密码引擎模块完成所述区块链客户端与云存储的加密交互；通过所述键值数据库中对用户数字证书、区块数据建立键值数据库记录；通过所述API接口对区块链客户端至少提供区块链的编辑功能，以及，对链上数据、用户数字证书的管理与维护；通过所述区块链客户端的云存储接口与所述云存储的API接口进行对接通信。本发明的有益效果为：为用户提供区块链链上数据的自定义存储方式，集中存储多个区块链的链上数据。