本发明提供一种基于订阅发布模式的变电站业务安全传输系统及方法，根据每一条变电站站内继电保护业务报文的特征，对进入系统端口的报文添加一个标记，使用该标记实现在系统内部传输时候提供精确到每一条业务流的业务安全传输和隔离，并在输出业务报文时候从系统的出端口剥离该标记，还原原始继电保护业务报文。本发明实现变电站业务基于订阅/发布模式的纯净传输和相关业务的安全隔离，并实现精细到具体业务流的故障定位。本发明实现变电站业务基于订阅/发布模式的纯净传输和相关业务的安全隔离，并实现精细到具体业务流的故障定位。本发明有效避免了广播风暴的影响并极大提高业务传送的安全性和便捷性。