一种过滤式固相萃取结合超临界流体色谱-质谱测定烟草中异丙菌胺和氟吡菌酰胺的方法，其特征在于：用乙腈通过磁力搅拌将样品中的异丙菌胺和氟吡菌酰胺萃取，以过滤式固相萃取技术净化后，以超临界流体色谱-串联质谱（SFC-MS/MS）测定烟草及烟草制品中异丙菌胺和氟吡菌酰胺农药残留量的方法。本发明的方法克服了现有技术样品处理方法的不足，填补了该类物质测定的空白，能够为相关残留限量的测定和方法技术的开发提供诸多借鉴，针对烟草和烟草制品优化了样品前处理方法和仪器检测条件，与现有技术相比本发明方法具有如下优良效果：本发明方法样品前处理过程简单、快速，具有操作准确、灵敏度高及重复性好的优点。