本发明公开了一种改性聚苯胺/水性环氧树脂复合防腐涂料及其制备方法，包括：将2‑氨基苯磺酸与高分子表面活性剂溶于稀盐酸中，滴加入苯胺和含有水溶性引发剂的稀盐酸，得到聚苯胺；将长链烷烃与四甲基乙二胺溶于乙醇溶液中并进行冷凝回流连续反应，得到阳离子性双子表面活性剂；将聚苯胺水溶液加入溶解有阳离子性双子表面活性剂的水溶液中，得到阳离子型双子表面活性剂改性的聚苯胺；将改性的聚苯胺溶于水中使其分散，加入环氧树脂乳液、固化剂、水、消泡剂、流平剂和润湿剂进行分散，得到阳离子型双子表面活性剂改性聚苯胺/环氧树脂复合防腐涂料。本发明的涂料用于金属表面防腐，可大幅提高金属的防腐蚀能力、耐水性等。