本发明公开了一种微生物发酵禽畜粪污制备有机肥料的设备及方法，包括依次连接的上料机、上料斗和发酵罐，发酵罐顶端连接有废气处理系统，发酵罐的出料处依次连接有成品输送设备和包装设备；制备方法包括上料-杀菌-发酵；本发明通过整合各个设备形成一个发酵处理的生产系统，提升发酵处理禽畜粪污的效率，限定各个过程中设备规格确保发酵进程的可控性，进而保证发酵效果；在发酵处理过程中，通过控制工艺参数及发酵过程，有效保证发酵顺利进行，确保产物的效果。