本发明公开了一种考虑初始不平衡量的航空发动机转子零件选配优化方法，S1、分别获取考虑装配误差条件和不考虑装配误差条件下的多级转子自身的复合静不平衡量和偶不平衡量；S2、依据矢量合成法则，确定多级转子组件的总静不平衡量和总偶不平衡量；S3、建立基于各级转子装配相位和零件选配方案的多级转子初始不平衡量的优化模型；S4、利用遗传算法对各级转子装配相位及零件选配方案进行双变量优化，得到各级转子周向最佳安装相位及最佳零件选配方案。解决了航空发动机转子装配初始不平衡量大、装配质量一致性差、振动大的问题。