本发明提供了一种风电场三相电流不平衡度确定方法及系统，包括：测试单台风电机组，获取电压和电流数据，并基于傅里叶系数计算单台风电机组的三相电流不平衡度，所述基于单台风电机组的三相电流不平衡度并按设定的区间统计有功功率和无功功率，计算整个风电场的三相电流不平衡度；本发明通过风电场中压侧采集三相瞬时电压与电流的十分钟时间序列，随后通过计算基波电流的傅里叶系数分别求得基波正序电流与负序电流，进而得到一分钟的三相电流不平衡度结果，缩短测试周期，减少测试成本。