本发明涉及一种适合摆动/启停复杂工况的船舶尾气洗涤净化系统及方法，包括连通的尾气预洗涤湍流调温段、紧凑型高效强化传质洗涤塔和多因子灵活调控系统。本发明针对不同海域、不同排放要求、不同气象条件、不同船舶发动机/运行工况等复杂条件下多种吸收剂SO2高效稳定低成本脱除的难题，提供了一种适合摆动/启停复杂工况的船舶尾气洗涤净化系统及方法，通过预洗涤湍流调温段快速调温-液体再分配构件强化气液混合-多因子灵活协同调控等装置和方法，实现了船舶尾气多种污染物尤其是SO2的低成本高效脱除，解决了塔体摆动、船舶快速启停、海水变化等工况下的高效稳定脱硫难题，为船舶尾气污染物的高效稳定安全可靠脱除提供支撑。