本发明公开了一种低损耗的水下检测机器人系统及其供电方法，系统包括水上电源、控制模块、电源路径管理电路、电池包、动力模块以及信号处理模块。供电方法：当水下机器人处于静态观察模式时，采用水上电源对水下机器人进行供电，电源路径电路切断电池放电回路，开通电池充电回路，对信号处理电路供电并对电池进行充电；当启动动力模块时，控制模块通过数字接口给电源路径管理电路发送启动命令，电源路径电路开启电池与动力模块之间的供电路径，使用电池对动力模块进行供电。根据水下装备的两类电源负载的不同特性，采用水上供电与水下设备内部电池供电组合的方法，降低水面以上供电设备的功率等级。