本发明涉及一种新型巴氏醋酸菌和嗜酸乳杆菌混合发酵生产高品质苹果醋的方法，本发明在苹果汁发酵前先加入嗜酸乳杆菌CTCT‑RS‑LGP‑0046，然后再加入酿酒酵母共同发酵成苹果酒；再接入巴氏醋酸菌CTCT‑CS‑LGP‑0003经过醋酸发酵将苹果酒转化成苹果醋，嗜酸乳杆菌CTCT‑RS‑LGP‑0046在苹果酒发酵过程中产乳酸能力强，巴氏醋酸菌CTCT‑CS‑LGP‑0003在苹果醋发酵过程中产非挥发性有机酸能力强，采用巴氏醋酸菌CTCT‑CS‑LGP‑0003和嗜酸乳杆菌CTCT‑RS‑LGP‑0046两株菌株，结合优化后的酒精发酵和醋酸发酵工艺，所获得苹果原醋非挥发性有机酸含量更高，口感更加柔和绵润。