本发明公开了一种岩溶地基变刚度子母桩及其施工方法。变刚度子母桩包括若干树根桩、土工格栅笼及固化土母桩；所述树根桩和土工格栅笼设置在固化土母桩内，固化土母桩置于岩溶地基的上覆软土层中，树根桩的上部位于土工格栅笼内，树根桩的轴线平行于土工格栅笼的轴线。本发明的岩溶地基变刚度子母桩单桩承载力高、桩身受力合理、用材少、施工简单、无需泥浆护壁、原岩土强度可利用、可设计成单柱单桩、成本低，可替代现有的嵌岩灌注桩应用于岩溶地基的桩基工程。