本发明公开了一种分隔式多酶‑MOF微囊及其制备方法，包括如下步骤：(1)自生长法制备MOF材料与葡萄糖氧化酶的复合物；(2)将辣根过氧化氢酶、丙烯酰胺、亚硫酸氢钠、过硫酸钾溶于去离子水，超声均匀混合作为水相；将步骤(1)制备的复合物分散于长链烷烃作为油相；通过高速剪切机将油水两相混合得到稳定的Pickering乳液；随后，将Pickering乳液密封，通氮除氧引发水相中的自聚反应，通过离心洗涤和真空干燥得到分隔式多酶‑MOF微囊。本发明条件温和，操作简便，极大的保留了酶的活性；制得“壁酶”与“芯酶”共存的分隔式的多酶结构，实现了联级催化反应效率的提升。