公开了一种自适应分频串联反射率反演方法及系统。该方法可以包括：针对地震叠前道集，通过自适应广义S变换，分别获得低频地震叠前道集、中频地震叠前道集、高频地震叠前道集；根据已知井数据及层位数据，建立低频地震初始模型；根据低频地震初始模型、低频地震叠前道集、中频地震叠前道集、高频地震叠前道集，计算高频弹性参数，即为最终反演结果。本发明通过自适应广义S变换与串联反演，实现反演结果与实际井曲线基本吻合，提高反演结果的分辨率、精度与效率。