本发明一种基于北斗短报文通信的电力业务数据编码传输方法、系统及存储介质；所述方法包括，将采集的电力业务数据，根据实际业务的要求和预先形成的数据字典进行编码后，生成电力业务消息并加入到消息队列中；电力业务消息包括用于标识电力业务数据的主帧和用于存放电力业务数据的数据内容；若电力业务消息长度不超过所用北斗短报文的数据传输上限，则该电力业务消息单条发送，否则该电力业务消息分包发送；若主帧中标识需要反馈，该电力业务消息发送未接收到反馈或接收到丢包反馈则重新发送该电力业务消息，直至接收到成功反馈后将该电力业务消息从消息队列中删除；若主帧标识不需要反馈，则该电力业务消息发送后即从消息队列中删除。