本发明涉及一种地下工程TBM穿越复杂软硬复合地层的施工方法，包括以下步骤：确定掘进前方软硬复合地层混合类型及开挖断面的软硬复合比；根据确定的软硬复合地层混合类型及隧道轴向上各断面的软硬复合比，划定掌子面前方软硬地层中的治理区域；设计适用于复杂软硬复合地层施工的注浆参数；对TBM掘进机前方地层的设计区域进行注浆加固；对划定的治理区域进行注浆加固；注浆效果进行评估，注浆效果达到设计要求后，TBM启动掘进，本发明的施工方法保证了TBM的安全掘进。