本发明涉及一种基于多装配序列的卫星装配工艺快速重构系统与方法，属于数字化制造技术领域。利用卫星产品三维设计模型自动生成所有可行的多个装配序列，并转换生成由主装配工艺、参考装配工艺文件构成的卫星装配工艺文件，支持车间装配现场出现待装配对象不齐套情况时，从卫星参考装配工艺文件中选取与后续装配工艺状态相匹配的装配序列，启动参考装配工艺文件作为主工艺指导下一步执行，以提升装配工艺的指导性与工艺响应能力，从而促进缩短卫星结构产品的装配研制周期。