本发明公开一种分段式水基磁流体脉动热管温差发电装置，属温差发电领域，该装置可使热能在脉动热管的高效传输过程中，利用特殊的水基磁流体液塞柱脉冲动能，切割永磁磁场磁力线，在分段式发电单元线圈两端输出脉冲电流，为传统的能源结构提供一种高效的温差发电模式。其特征在于将一段内径在1.5毫米以下的耐高温绝缘材料制成的毛细圆管外缠绕金属线圈，线圈外均布围绕永磁材料及保温护套，作为发电单元，多组发电单元与多组导热板间隔串联组成毛细管全导通状，整体毛细管以脉动热管结构封装工艺，组成分段式水基磁流体脉动热管发电装置。