本发明公开了一种基于种群多样性控制的脑电源定位方法、系统及设备，基于患者的个性化MRI，构建患者的个性化真实头模型与源模型。通过基准点法实现EEG‑MRI的粗略配准，通过对电极位置手动微调，实现EEG‑MRI的精细配准，降低空间模型产生的误差。基于配准后的空间信息，建立体积传导模型，计算正向传导矩阵，进而建立源定位数学模型，为降低计算复杂度，对源定位数学模型进行线性与非线性参数分离。面对逆问题的不适定性与病态性，提出一种基于种群多样性控制的量子粒子群算法(DQPSO)，通过控制算法的种群多样性，使算法迭代后期仍然能够保持较高的全局遍历寻优能力，进而提高算法收敛到全局最优的概率，保证高定位精度。