本发明公开了一种长距离线性工程渠堤内部隐患综合检测方法，1，利用阵列地质雷达对渠堤深度范围0～2.5m进行巡检探测，划分出渠堤浅部脱空、渗漏、裂缝疏松区域；2，利用拖曳式瞬变电磁法对渠堤2～50m深度范围进行巡检探测，划分出渠堤该深度范围的软弱夹层、渗漏区域；3，按渠堤隐患风险排序为正常渠段、低风险渠段和高风险渠段；4，对高风险渠段采用连续源面波获取该段0～50m深度范围的波速，圈定横向裂缝、脱空隐患具体位置；5，采用点测方式获取0～30m范围内高精度电阻率；6，将上述各种检测方法结果进行地质建模，形成渠堤工程地下空间隐患三维展布。本发明实现渠堤内部隐患摸底排查，为预防隐患的发生、发展提供了先验条件。