本发明提出一种以发酵池为热源的土壤加热系统，该加热系统的循环水泵一端连接蓄热水箱，一端连接发酵池，发酵池通过管道连接蓄热水箱，形成回路，供水泵一端连接蓄热水箱，一端通入地下加热土壤区域，最后经回水管回到蓄热水箱，形成回路，蓄热水箱内设置有高温气体换热装置。解决了目前单级太阳能供暖系统无法在夜间持续供暖和其它互补供暖系统中如电供暖、燃烧、热泵等方式带来的能源消耗、不稳定性、环境污染及经济问题，提出一种以发酵池为热源的土壤加热系统，利用廉价且易获取的秸秆和粪便等原料构成发酵池，充分利用发酵池排出的高温气体和其自身微生物的氧化分解产热，将热量传递给热水进而实现土壤加热。