本发明公开了一种基于PWM能馈变流器的回馈控制方法及系统。方法包括PWM能馈变流器直流侧接入直流接触网，交流侧通过变压器接入交流电网；检测时间滑动窗内的两个直流接触网电压；计算直流接触网电压变化值△U；比较直流接触网电压变化值△U和控制系统的预设条件，判断系统工况；若符合预设的系统工况，同时直流电压值达到设定阈值，则PWM能馈变流器根据判断结果进行实时调整。系统包括能馈变流器接入装置，电压检测装置，电压变化计算装置，工况判断装置，调整装置。本发明通过直流接触网电压的变化判断出列车的运行状态，解决了PWM变流器工程应用中的稳定性及可靠性的问题，从而控制PWM整流器准确投入，达到供电系统节能的目的，判据简单、准确。