本发明公开了一种深海多金属硫化物资源的勘探保留区圈定方法，适用于在海底硫化物找矿调查后，经过远景区圈定与评价，圈定勘探保留区块，以备开展进一步勘探。该方法包括以下步骤：首先是找矿标志提取阶段；包括提取深海硫化物资源找矿标志，指定标志的特征，划定标志的级别；其次是成矿远景区评价阶段；包括各种找矿标志控制范围的划定，以及基于找矿标志圈定远景区；最后是勘探保留区圈定阶段；包括综合各类找矿标志信息进行预测，确定远景区级别，依次把较高级别的远景区作为资源保留区。本发明可以应用于深海多金属硫化物资源的评价与预测，特别是深海多金属硫化物的资源勘探保留区圈定。