本发明公开了一种桥梁加固控制方法及系统，所述方法包括：根据病害桥跨类型选定对比桥跨；监测病害桥跨和对比桥跨在相同的荷载条件下典型截面的结构响应参数；根据病害桥跨和对比桥跨的结构响应参数，确定病害桥跨加固方案；对病害桥跨施加结构预应力，对比病害桥跨和对比桥跨的实时结构响应参数，当病害桥跨结构响应参数不满足预设加固条件时，逐级调节结构预应力补强程度；当病害桥跨的结构响应参数满足预设加固条件时，终止调节结构预应力补强程度。所述系统包括：对比桥跨选定单元、对比参数监测单元、加固方案确定单元和结构预应力调节单元。本发明能够准确推测病害桥跨的损伤程度，实时动态监测结构响应参数，确保桥梁加固效果。