本发明公开了一种基于功能化纳米探针的单细胞电化学传感器及其应用，属于电化学传感器和毒素检测技术领域。本发明所述的单细胞电化学传感器是利用纳米探针和电化学细胞传感器结合，使用普鲁士蓝对纳米探针进行功能化修饰，通过显微操作平台对单个细胞进行电流信号分析。本发明构建了一种可靠、操作简便、可重复性强的单细胞电化学检测平台，通过电化学计时电流法测定其电流值判断单个细胞受毒素刺激后的受损情况，从而快速、有效地评价真菌毒素细胞毒性，进一步使真菌毒素毒性在活细胞中实时监测和纳米环境检测中得到应用。