本发明公开了一种基于进化神经网络结构搜索的食管癌病变区域识别建模方法，涉及图像模式识别及医学图像的技术领域，包括如下步骤：S1：采集并标注用于训练神经网络模型的食管图像数据集；S2：构建用于食管癌病变区域识别的神经网络结构搜索空间；S3：训练面向食管癌病变区域识别的超网络模型；S4：使用进化算法在构建的超网络模型上搜索最优神经网络结构；S5：微调搜索到的神经网络结构，并预测新输入的食管图像上的病变区域。本发明消除食管癌智能识别任务中神经网络结构设计对于专家经验的依赖，使得深度神经网络方法在食管癌病变区域识别方面更加容易使用。